Program studi Teknik Informatika merupakan salah satu program studi yang ada di Fakultas Sains dan Teknologi UNISNU Jepara yang mulai beroperasional sejak 26 April 2013 dengan SK Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Nomor 149/E/O/2013. Program Studi Teknik Informatika mempunyai kompetensi dalam perancangan dan implementasi sistem perangkat lunak maupun Infrastruktur IT dalam menyelesaikan permasalahan di bidang Informatika. 

kurikulum yang disusun berdasarkan pada KKNI seperti yang tertuang pada Peraturan Presiden Nomor 8 Tahun 2012, dan juga pada OBE (Outcome-Based Education).  OBE dijadikan salah satu basis penyusunan kurikulum ini karena pada Peraturan Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi Nomor 4 Tahun 2017 disebutkan bahwa penilaian akreditasi diarahkan pada capaian kinerja tridharma perguruan tinggi (outcome based accreditation); dimana yang dimaksud dengan outcome based accreditation ini adalah akreditasi program studi berfokus pada ketercapaian capaian pembelajaran lulusan (CPL).

Profil lulusan dari program studi Teknik Informatika akan menjadi Software Engineer dan IT Infrastruktur. Dalam proses pembelajaran, Program studi Teknik Informatika menggunakan Kurikulum KKNI Kampus Merdeka Berbasis OBE yang disesuaikan dengan standar APTIKOM (Asosiasi Perguruan Tinggi Informatika dan Komputer).

1)      Visi :

Pada tahun 2023 menjadi Program Studi Teknik Informatika yang unggul dalam mengembangkan Iptek,  serta sumber daya manusia yang cendikia,berakhlakul karimah dan berkepribadian Ahlusunnah Wal Jama’ah di tingkat Nasional.

2)      Misi :

1.     Melaksanakan sistem pendidikan yang berkarakter ahlussunnah wal jama’ah

2.  Menyelenggarakan pendidikan yang unggul dalam bidang Teknik Informatika, sehingga menghasilkan lulusan yang memiliki keunggulan kompetitif, beretika dan bermoral.

3.   Mengembangkan ilmu pengetahuan dan teknologi terutama melalui kegiatan penelitian yang bermutu, publikasi ilmiah serta kepemilikan hak atas kekayaan intelektual sebagai upaya pengembangan ilmu pengetahuan kerekayasaan dan teknologi.

4.     Melaksanakan pengabdian kepada masyarakat untuk memecahkan persoalan masyarakat sebagai upaya penetapan dan pengembangan ilmu pengetahuan Teknik Informatika.

5.   Melakukan evaluasi secara teratur untuk meningkatkan kualitas, profesionalisme, kapabilitas, akuntabilitas dan tata kelola serta kemandirian dalam penyelenggaraan program studi.